Indaiatuba oferece através de sua Secretaria de Esportes uma série de modalidades esportivas. São 34 modalidades em 24 núcleos esportivos, muitas delas que estiveram presentes nos Jogos Olímpicos de Paris 2024 e inclusive uma das novidades para os jogos de Los Angeles 2028.
Dentre esses programas permanentes estão o Projeto Esporte Cidadão (para faixa etária de 6 a 14 anos); o Projeto Juventude Esportiva, que contempla a faixa etária de 15 a 21 anos; o Projeto de Lazer em duas vertentes; e o Projeto do Esporte Competitivo, que visa à representação da cidade em várias modalidades.
A cidade ainda conta com o Programa de Esporte de Alto Rendimento, que apoia a prática de 26 modalidades esportivas, com apoio logístico aos atletas, treinamento e aperfeiçoamento e parceria com a iniciativa privada
Futebol
A modalidade é oferecida em duas unidades, no Jardim Paulistano, Jardim São Conrado, Cidade Nova, Jardim Rômulo Zoppi e também no Sesi, com aulas de segunda a quinta-feira, sempre no final da tarde.
Vôlei
Uma das práticas com mais oferta de aulas, o vôlei é praticado em pelo menos cinco espaços esportivos, com aulas na parte da manhã e também no período da tarde.
Ginástica
Queridinha dos brasileiros, a Ginástica Artística geralmente registra um aumento de interessada após as Olimpíadas. Em Indaiatuba, no Cento de Ginástica são oferecidas aulas de ginástica artística; enquanto no Ginásio Primavera acontecem as aulas de ginástica rítmica. As duas modalidades também são oferecidas no Polo Esportivo Claudio Urbini De Freitas.
Bicicross e skate
Modalidades outdoor foram responsáveis por boa parte das medalhas do Brasil. Em Indaiatuba, duas delas contam com treinamentos específicos. A pista de bicicross oferece aulas da modalidade às terças e quintas-feiras, enquanto na pista de skate, são oferecidas as aulas de skate.
Atletismo
O atletismo de Indaiatuba sempre fatura bons resultados nas competições. Tanto no Sesi quanto no Centro Esportivo do Trabalhador, no bairro Cidade Nova, acontecem aulas duas vezes por semana.
Beisebol
Novidade para a próxima edição dos Jogos Olímpicos, o beisebol é um destaque em Indaiatuba. As aulas são oferecidas no Sesi, às terças e quintas-feiras. Em parceria com a Associação Cultural Esportiva Nipo Brasileira de Indaiatuba, é oferecido o programa Base de Beisebol tem como objetivo introduzir os participantes ao esporte.
Além deles, são oferecidas aulas de handebol, natação, basquete, judô, taekwondo, esgrima, tênis e tênis de mesa.