Menos de 3% da população não sabe ler ou escrever, o que representa aproximadamente 2.800 pessoas. No Estado, cidade ocupa a 39ª colocação entre as menores taxas, conforme dados do Censo 2022.
A melhor cidade paulista é Águas de São Pedro, com 98,76% da população alfabetizada. Entre as cidades da região, Indaiatuba tem a 13ª menor taxa de analfabetismo do Estado, com 97,88% da população tendo os conhecimentos básicos de escrita e leitura.